Το πρώτο περιστατικό σημειώθηκε το απόγευμα της Παρασκευής 7 Νοεμβρίου, όταν οι λιμενικές αρχές ενημερώθηκαν για λέμβο με μετανάστες σε δυσχερή θέση, έξι ναυτικά μίλια νότια-νοτιοδυτικά των Καλών Λιμένων. Στο σημείο προσέγγισε το ρυμουλκό «Πύρρος», το οποίο εντόπισε τη λέμβο και περισυνέλεξε 28 υπηκόους Σουδάν, καθώς και τη σορό ενός άνδρα.
Όπως ανέφεραν οι διασωθέντες, δύο ακόμη επιβαίνοντες είχαν πέσει στη θάλασσα και αγνοούνταν. Το Λιμενικό αναφέρει ότι οι θυελλώδεις βόρειοι άνεμοι, έντασης 6-7 μποφόρ, κατέστησαν ιδιαίτερα επικίνδυνη την προσπάθεια ρυμούλκησης και περαιτέρω περισυλλογής. Υπό άγνωστες συνθήκες, η λέμβος σύμφωνα με το Λιμενικό χάθηκε, και εντοπίστηκε εκ νέου τις πρώτες πρωινές ώρες, με επτά ακόμη σορούς στο εσωτερικό της, και μεταφέρθηκε στους Καλούς Λιμένες.
Σε δεύτερο περιστατικό, 15 ναυτικά μίλια νοτιοανατολικά των Καλών Λιμένων, παραπλέον πλοίο μεταφοράς εμπορευματοκιβωτίων με σημαία Μαρόκου εντόπισε άλλη λέμβο. Στην περιοχή έφτασε πλωτό του Λιμενικού, το οποίο περισυνέλεξε 18 επιζώντες και 12 σορούς. Οι διασωθέντες μεταφέρονται στο λιμάνι της Αγίας Γαλήνης.
Συνολικά, από τα δύο περιστατικά προκύπτουν 20 νεκροί: ο ένας άνδρας που εντοπίστηκε αρχικά από το ρυμουλκό, οι επτά σοροί που βρέθηκαν αργότερα στην ίδια λέμβο και οι 12 νεκροί του δεύτερου περιστατικού.
Την ίδια ώρα, σε δύο επιπλέον επιχειρήσεις, περίπου 30 και 31 ναυτικά μίλια νότια των Καλών Λιμένων, εντοπίστηκαν δύο ακόμη λέμβοι που μετέφεραν περίπου 47 και 40 ανθρώπους αντίστοιχα.
Οι επιβαίνοντες περισυνελέγησαν από σκάφη της Frontex, έπειτα από τον εντοπισμό των λέμβων με τη συνδρομή επανδρωμένου και μη επανδρωμένου εναέριου μέσου. Οι διασωθέντες μεταφέρονται στους Καλούς Λιμένες.
Από τους 28 ανθρώπους που διασώθηκαν στο πρώτο περιστατικό, δύο μεταφέρθηκαν στο Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Ηρακλείου (ΠΑΓΝΗ) για νοσηλεία, ενώ οι υπόλοιποι οδηγήθηκαν στο Ηράκλειο.
Σύμφωνα με τις μαρτυρίες των διασωθέντων, οι άνθρωποι που επέβαιναν στην πρώτη λέμβο είχαν αναχωρήσει από τις ακτές της Λιβύης στις 3 ή 4 Νοεμβρίου.
Για την υπόθεση συνελήφθησαν δια της γνωστής μεθόδου της ποινικοποίησης των οδηγών, αν και αυτομεταφερόμενοι, και υπό τις γνωστές συνθήκες προανάκρισης – όσο είναι ακόμη βρεγμένοι, συνήθως σε γλώσσα που δεν κατανοούν, σε μία fast track διαδικασία – δύο υπήκοοι Σουδάν, ηλικίας 28 και 16 ετών, οι οποίοι σύμφωνα με το Λιμενικό «αναγνωρίστηκαν από άλλους επιβαίνοντες ως διακινητές».
Σε βάρος τους σχηματίστηκε δικογραφία για παράνομη είσοδο στη χώρα, διευκόλυνση παράνομης εισόδου, σύσταση συμμορίας και θανατηφόρα έκθεση.