Σύμφωνα με τις οδηγίες που δόθηκαν προς τις εφορίες για τους φορολογούμενους για τους οποίους έχει εκδοθεί το Ατομικό Φύλλο Έκπτωσης(ΑΦΕΚ), αν ο φορολογούμενος δικαιούται επιστροφή και έχει οφειλές προς το Δημόσιο, τότε το ΑΦΕΚ εξοφλείται συμψηφιστικά αυτεπαγγέλτως από την ΔΟΥ.
Αν ο φορολογούμενος ο οποίος δικαιούται επιστροφή, δεν έχει οφειλές προς το Δημόσιο ή υπολείπεται επιστροφή μετά τον συμψηφισμό των οφειλών, τότε για ΑΦΕΚ επιστροφής κάτω των 300.000 ευρώ, θα του αποσταλεί εντός δέκα ημερών από την εκκαθάριση του ΑΦΕΚ, ειδοποιητήριο προκειμένου να προσέλθει στην ΔΟΥ με τα δικαιολογητικά και να παραλάβει το ποσό.
Η αποπληρωμές θα γίνουν είτε άμεσα, είτε θα πιστωθούν σε τραπεζικούς λογαριασμούς των δικαιούχων εντός 5 ημερών από την προσκόμιση των δικαιολογητικών.
Για ΑΦΕΚ επιστροφής άνω των 300.000 ευρώ, η αποπληρωμή θα γίνει εντός δύο μηνών από την εκκαθάριση του ΑΦΕΚ, καθώς απαιτείται έγκριση από τον υπουργό Οικονομικών.