Ένα χρόνο μετά την αποφυλάκιση του, συμπληρωματική απολογία έδωσε στην ειδική ανακρίτρια Μαρία Τόλια ο πρώην υπουργός Εθνικής Άμυνας , Γιάννος Παπαντωνίου, και η σύζυγος του, Σταυρούλα Κουράκου, για την υπόθεση του εκσυγχρονισμού των έξι φρεγατών του Πολεμικού Ναυτικού για την οποία έχει κατηγορηθεί. Η νέα κλήση σε απολογία στον Γιάννο Παπαντωνίου εστάλη μετά την ολοκλήρωση της συμπληρωματικής ανάκρισης που είχε διατάξει τον Απρίλιο του 2020 το αρμόδιο δικαστικό Συμβούλιο. Στην αρμόδια ανακρίτρια απολογούνται συμπληρωματικά η σύζυγος του και ένας επιχειρηματίας.
Μετά το τέλος της συμπληρωματικής του απολογίας ο κ. Παπαντωνίου δήλωσε πως: «Δεν μου επιβλήθηκε κανένας όρος . Είναι ένα ξεκάθαρο δείγμα ότι η ελληνική δικαιοσύνη αρχίζει και πια να να λειτουργεί ανεξάρτητα με βάση το νόμο και με βάση τη δικογραφία. Αυτό αποτελεί ένα θετικό βήμα το οποίο νομίζω ότι πέρα από δική μου περίπτωση δημιουργεί κάποια αισιοδοξία».
Ο πρώην υπουργός αντιμετωπίζει και άλλη δικαστική εμπλοκή, που σχετίζεται με την πώληση ιδιόκτητου ακινήτου στη Σύρο, πώληση που ελέγχεται δικαστικά ως εικονική, κάτι που επίσης ο Γιάννος Παπαντωνίου αρνείται. Όπως μάλιστα δήλωσε ο συνήγορός του Μιχάλης Δημητρακόπουλος: «Πλήττεται το κράτος δικαίου όταν ασκούνται ποινικές διώξεις σε βάρος πολιτών για το αδίκημα της δωροδοκίας όπου ψάχνονται και δεν υπάρχουν οι άνθρωποι οι οποίοι υποτίθεται ότι δωροδόκησαν».
Ενώπιον της ανακρίτριας πρόκειται να βρεθεί σήμερα (22.04.2021) ο πρώην υπουργός Εθνικής Άμυνας, Γιάννος Παπαντωνίου, για την υπόθεση των 2.437.962 ευρώ που φέρεται να έλαβε ως προϊόν δωροδοκίας από την “THALES NEDERLAND B.V.” στο πλαίσιο της προώθησης της σύμβασης για τον εκσυγχρονισμού των έξι φρεγατών του Πολεμικού Ναυτικού που υπογράφηκε το 2003.
Συγκεκριμένα, το δικαστικό συμβούλιο, με βούλευμα του είχε διατάξει περαιτέρω ανακριτικές πράξεις όσον αφορά στο αδίκημα που αποτέλεσε τη βάση για το ξέπλυμα των 2.835.197, 05 ελβετικών φράγκων (2.437.962 ευρώ). Έτσι η ανακρίτρια, στην οποία επέστρεψε η δικογραφία προσδιόρισε εκτός της απιστίας και την δωροδοκία ως το βασικό αδίκημα που οδήγησε στο ξέπλυμα. Τότε, σε δηλώσεις του, έκανε λόγο για «πολιτική σκευωρία» που στήθηκε σε βάρος του με ηθικούς αυτουργούς την πρώην εισαγγελέα διαφθοράς, Ελένη Τουλουπάκη και τον πρώην αναπληρωτή υπουργό Δικαιοσύνης, Δημήτρη Παπαγγελόπουλο, ενώ, είχε επισημάνει ότι η κλήση του ίδιου και της συζύγου του σε συμπληρωματική απολογία έχει καθαρά τυπικό χαρακτήρα.
«Χρειάστηκε θράσος για να απευθύνουν σε βάρος μου την απεχθή κατηγορία την οποία αντιμετωπίζω και τέσσερα χρόνια. Είναι όμως ευτύχημα ότι η σημερινή ανακρίτρια μας κάλεσε με τη σύζυγό μου σε συμπληρωματική απολογία που έχει καθαρά τυπικό χαρακτήρα. Και το μόνο το οποίο ζητώ είναι και το ζητώ επίμονα είναι δικαίωση και μια συγνώμη. Και κυρίως να κριθώ το συντομότερο δυνατό από τη δικαιοσύνη. Εμπιστεύομαι τη δικαιοσύνη επειδή η τεράστια πλειοψηφία με εξαίρεση ελάχιστους επίορκους δικαστές εκτελεί με πάθος και εντιμότητα το καθήκον της στο πλαίσιο του δημοκρατικού πολιτεύματος. Όσα υποστήκαμε αποτελούν σελίδες ντροπής για τη δημόσια ζωή και τους θεσμούς» ανέφερε χαρακτηριστικά ο πρώην υπουργός.