Η υπουργός Παιδείας επικαλέστηκε σχετικές αποφάσεις του ΣτΕ και δήλωσε μιλώντας στο ΣΚΑΪ πως «δεν μπορεί να δίνεται η δυνατότητα απαλλαγής από τα θρησκευτικά σε χριστιανούς ορθόδοξους μαθητές». Η ίδια ισχυρίστηκε πως η Αρχή Προστασίας Δεδομένων Προσωπικού Χαρακτήρα, μπορεί να λέει ότι η απαλλαγή μπορεί να δίνεται στον οποιονδήποτε, ανεξαρτήτως θρησκεύματος, ωστόσο «το ΣτΕ, το οποίο είναι το ανώτατο διοικητικό δικαστήριο της χώρας, έχει βγάλει τέσσερις αποφάσεις, στις οποίες λέει ξεκάθαρα ότι η απαλλαγή μπορεί να δίνεται μόνο τους άθεους και σε αυτούς από άλλα θρησκεύματα. Δεν μπορεί να δίνεται σε όσους είναι χριστιανοί ορθόδοξοι», προσθέτοντας, δε, ότι η πολιτεία οφείλει να συμμορφωθεί με το ανώτατο δικαστήριο της χώρας.
Όμως η Ολομέλεια του Συμβουλίου της Επικρατείας (ΣτΕ), με την υπ’ αριθμ. 1478/2022 απόφασή της, ακύρωσε Κοινή Υπουργική Απόφαση του 2021, κατά το μέρος που προβλέπεται η απαλλαγή των μαθητών από το μάθημα των Θρησκευτικών, καθώς δεν προηγήθηκε της έκδοσης της ΚΥΑ η γνώμη της Αρχής Προστασίας Δεδομένων Προσωπικού Χαρακτήρα για αυτό το θέμα.Υπενθυμίζεται ότι κατά την πρόσφατη γνωμοδότησή της η ΑΠΔΠΧ προτείνει ότι την απαλλαγή από το μάθημα των θρησκευτικών, μπορούν να πάρουν όλοι οι αιτούντες και οι Ορθόδοξοι χριστιανοί μαθητές, με επίκληση απλώς και μόνον λόγων συνείδησης.