Εκφράζοντας ανάλογη κριτική, όπως αυτή που άσκησε πρόσφατα η Ρωσία, η οργάνωση ανακοίνωσε ότι πολλοί Λίβυοι που δεν συμμετείχαν στη σύγκρουση, σκοτώθηκαν ή τραυματίστηκαν από τους ΝΑΤΟϊκούς βομβαρδισμούς, αλλά δεν έχουν διενεργηθεί οι προσήκουσες έρευνες για τον θάνατό τους.
 
«Οι αξιωματούχοι του ΝΑΤΟ επανειλημμένως τόνισαν την δέσμευσή τους για την προστασία των αμάχων» αναφέρει σε ανακοίνωσή της η Ντονατέλα Ροβέρα, ανώτατη σύμβουλος της οργάνωσης.
 
Οι έρευνες θα πρέπει να αποφανθούν αν οι απώλειες των αμάχων προκλήθηκαν από την παραβίαση του διεθνούς δικαίου και, αν ναι, οι όποιοι υπεύθυνοι να οδηγηθούν στην δικαιοσύνη, ανακοίνωσε η Αμνηστία.
 
Η στρατιωτική αποστολή του ΝΑΤΟ, η οποία εξουσιοδοτήθηκε από το Συμβούλιο Ασφαλείας των Ηνωμένων Εθνών, ξεκίνησε στις 31 Μαρτίου του 2011 με στόχο την προστασία των αμάχων που δέχονταν επιθέσεις ή που απειλούνταν με επιθέσεις. 
 
Οι εμπειρογνώμονες του Συμβουλίου Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων των Ηνωμένων Εθνών κατέληξαν στις αρχές του μήνα στο συμπέρασμα ότι το ΝΑΤΟ προκάλεσε τους θανάτους αμάχων αλλά έλαβε προληπτικά μέτρα για να εξασφαλίσει ότι δεν θα σκοτώνονταν άμαχοι.
 
Η Αμνηστία συμφωνεί ότι το ΝΑΤΟ κατέβαλε σημαντικές προσπάθειες για να περιορίσει τον κίνδυνο απωλειών αμάχων μέσω των βομβαρδισμών ακριβείας και των προειδοποιήσεων για το ποιοι θα είναι οι στόχοι.
 
Ωστόσο, η οργάνωση υποστηρίζει ότι αυτό δεν απαλλάσσει το ΝΑΤΟ από την διενέργεια έρευνας για τις συνθήκες θανάτου των αμάχων ή από την καταβολή αποζημιώσεων στις οικογένειες των θυμάτων.
 
Οι επιζήσαντες και οι συγγενείς των θυμάτων οι οποίοι μίλησαν στην Αμνηστία είπαν ότι ποτέ δεν επικοινώνησαν μαζί τους εκπρόσωποι της Συμμαχίας.
 
Η οργάνωση είπε ότι το ΝΑΤΟ ανέφερε 55 περιπτώσεις θανάτων αμάχων, περιλαμβανομένων 16 παιδιών και 14 γυναικών, που σκοτώθηκαν από τις αεροπορικές επιδρομές στην Τρίπολη, στην Ζιντάν, την Σύρτη, την Μπρέγκα και την Μάχερ, που συχνά είχαν ως στόχους κατοικίες.
 
Επιπλέον, 34 άνθρωποι, ανάμεσά τους οκτώ παιδιά, σκοτώθηκαν σε τρεις διαφορετικές επιθέσεις με στόχο δύο σπίτια στην Μάχερ χωρίς εξήγηση για τους λόγους που αυτά αποτέλεσαν στόχο, είπε η Αμνηστία.
 
Η πιο πρόσφατη απάντηση του ΝΑΤΟ στην Αμνηστία ανέφερε ότι «λυπάται βαθύτατα για το όποιο κακό» προκάλεσαν οι βομβαρδισμοί του, αλλά ότι δεν έχει πλέον εντολή για οποιασδήποτε μορφής δράση εντός της Λιβύης.