O Μόρσι καταδικάστηκε για την ευθύνη του στον θάνατο διαδηλωτών το 2012. Η απόφαση μπορεί να εφεσιβληθεί.
 
Στην ίδια δίκη, που ολοκληρώθηκε την Τρίτη, καταδικάστηκαν επίσης σε 20 χρόνια κάθειρξη τα στελέχη της «κορυφής» των -εκτός νόμου πλέον- Αδελφών Μουσουλμάνων Μοχάμεντ ελ Μπελνταγκί και Εσάμ ελ Εριάν. 
 
Συνολικά, εκτός από τον έκπτωτο πρόεδρο, καταδικάστηκαν 12 ηγετικά στελέχη.
 
 

Σήμα από το κλουβί
 

Στη δίκη που μεταδόθηκε ζωντανά στην τηλεόραση, ο Μόρσι και οι υπόλοιποι κατηγορούμενοι έκαναν μέσα από το κλουβί το σήμα με τα τέσσερα δάχτυλα -σύμβολο για το αιματοκύλισμα οπαδών των ισλαμιστών στο τζαμί Ραμπά αλ Ανταουίγια τον Αύγουστο του 2013, τις ταραγμένες εβδομάδες μετά την ανατροπή του ισλαμιστή προέδρου. 
 
Η δίκη που ολοκληρώθηκε είναι από εκείνες που έχουν κινηθεί σε βάρος του. Ο Μόρσι κρατείται σε φυλακή υψίστης ασφαλείας στην Αλεξάνδρεια, όπου είχε μεταφερθεί τέσσερις μήνες μετά την κράτησή του σε άγνωστη τοποθεσία.