Η πρυτανεία αποφάσισε ομόφωνα ότι δεν προκύπτει κανένας λόγος από πράξεις ή παραλείψεις του  επίμαχου Πρύτανη που να δικαιολογεί την παραπομπή του στο Πειθαρχικό Συμβούλιο, ενώ  έκριναν ότι η Σύγκλητος δεν έχει αρμοδιότητα εκ του νόμου να αποφασίσει επί του αιτήματος του υπουργού Παιδείας.
 
Ο υπουργός Παιδείας απέστειλε στον πρόεδρο του Συμβουλίου της Επικρατείας και πρόεδρο του Πειθαρχικού Συμβουλίου των Μελών του ΔΕΠ των Ανωτάτων Εκπαιδευτικών Ιδρυμάτων Σωτήρη Ρίζο, την  πειθαρχική δίωξη σε βάρος του Θεοδόση Πελεγρίνη  με την κατηγορία της παράβασης καθήκοντος.

Ο Πρόεδρος του ΣτΕ θα ορίσει άμεσα τον εισηγητή, ο οποίος θα κάνει πρόταση για την παραπομπή ή όχι του κ. Πελεγρίνη στο Πειθαρχικό Συμβουλίου.
Εάν κριθεί ότι πρέπει να ασκηθεί πειθαρχική δίωξη σε βάρος του Πρύτανη, τότε θα παραπεμφθεί οριστικά στο Πειθαρχικό Συμβουλίου των Μελών του ΔΕΠ.

Σε περίπτωση που αποφασιστεί από το Πειθαρχικό Συμβούλιο να ασκηθεί πειθαρχική δίωξη σε βάρος του κ. Πελεγρίνη, τότε ο υπουργός Παιδείας έχει τη δυνατότητα να τον θέσει σε προσωρινή αργία.
Εισηγητής ο οποίος θα οριστεί από τον κ. Ρίζο θα είναι ένας δικαστής από τον Άρειο Πάγο ή το Ελεγκτικό Συνέδριο.

Σε περίπτωση που εισηγητής οριστεί από το Ελεγκτικό Συνέδριο, τότε από τον  Άρειο Πάγο  θα συμμετέχει ο αρχαιότερος αρεοπαγίτης. Εάν εισηγητής οριστεί από τον  Άρειο Πάγο, τότε από το Ελεγκτικό Συνέδριο θα συμμετέχει ο αρχαιότερος από τους συμβούλους.
 

Το Συμβούλιο Διοίκησης κατά του Πρύτανη


«Το Συμβούλιο του Ιδρύματος, που αναδείχθηκε με την ψήφο του 80% του διδακτικού προσωπικού του Πανεπιστημίου μας, προσπαθεί από την πρώτη στιγμή που ανέλαβε τα καθήκοντά του να ανταποκριθεί στον ρόλο του ο οποίος, κατά το νόμο, είναι η εποπτεία και ο έλεγχος της λειτουργίας του Πανεπιστημίου και η υποστήριξη των σκοπών του, πρωτίστως, της ακαδημαϊκής εκπαίδευσης και της έρευνας.
 
Προς τη κατεύθυνση αυτή επιδιώκει σταθερά να συνεργαστεί με τις Πρυτανικές Αρχές και την ακαδημαϊκή κοινότητα για ένα ισχυρό Δημόσιο Πανεπιστήμιο παρά τα προσκόμματα που έθεταν και θέτουν όσοι πολέμησαν και πολεμούν το θεσμό του Συμβουλίου και αμφισβητούν τη νομιμότητά του.
 
Σήμερα το Πανεπιστήμιο είναι κλειστό, κατάσταση που διαρκεί επί τρεις μήνες και είναι ανήκουστη για οποιοδήποτε μέρος του κόσμου. Απεργούν τα μέλη του Διοικητικού Προσωπικού για να διαφυλάξουν την εργασία τους απέναντι στο μέτρο της διαθεσιμότητας που έπληξε και το Πανεπιστήμιό μας, με τρόπο που δεν επέτρεπε σοβαρή αξιολόγηση των δομών και των προσώπων. Εν τούτοις, η παροχή του δημόσιου αγαθού της πανεπιστημιακής εκπαίδευσης για την οποία πληρώνουν οι φορολογούμενοι πολίτες από το υστέρημά τους δεν θα έπρεπε κατά ουδένα τρόπο να διακοπεί.
 
Το Συμβούλιο του Ιδρύματος, με επανειλημμένες ανακοινώσεις του κάλεσε τον Πρύτανη του Πανεπιστημίου Αθηνών κ. Πελεγρίνη, να προστατεύσει τους άξιους υπαλλήλους του Ιδρύματος, απαραίτητους για τη λειτουργία του, να διαφυλάξει τις εκπαιδευτικές και ερευνητικές διαδικασίες και το κύρος του θεσμού. Το Συμβούλιο δεν ζήτησε ποτέ από τον Πρύτανη να καλέσει την αστυνομία για να αποκαταστήσει την ακαδημαϊκή λειτουργία του ΕΚΠΑ, κάτι που αποτελεί δική του αρμοδιότητα και της Συγκλήτου. Ζήτησε να μην προβαίνει σε απλές προσχηματικές διαπιστώσεις περί αντικειμενικής αδυναμίας λειτουργίας του Πανεπιστημίου και να ασκήσει ο ίδιος και η Σύγκλητος τις αρμοδιότητές τους ώστε να ανοίξουν οι σχολές και να γίνονται τα μαθήματα, όπως συνέβη σε άλλα Πανεπιστήμια όπου απεργούσαν οι διοικητικοί υπάλληλοι. Δηλαδή, να απαιτήσει προσωπικό ασφαλείας (οι απεργοί διέθεταν συνολικά 11 άτομα -εκ των οποίων 4 για τη μισθοδοσία- για όλο το Πανεπιστήμιο και το πλήθος των κτηρίων του ΕΚΠΑ), να ελέγξει διοικητικά όσους δεν ανταποκρίνονται στο ανωτέρω καθήκον και να αναθέσει σε ιδιωτική εταιρεία φύλαξης, που επί σειρά ετών χρησιμοποιεί το Πανεπιστήμιο, τη φύλαξη των κτηρίων.
 
Αντ' αυτών ο κ. Πελεγρίνης πρωταγωνίστησε σε ανεύθυνες ενέργειες που είχαν πολύ σοβαρό κόστος τόσο για τους φοιτητές όσο και για το διδακτικό προσωπικό και έβλαψαν το έργο και το κύρος του ΕΚΠΑ και οι οποίες απαριθμούνται στην εκτενή ανακοίνωση του Συμβουλίου της 5ης/11/2013. Δεν προστάτευσε ούτε το διοικητικό προσωπικό που απεργεί, διότι σήμερα έφθασε να διεκδικεί αυτό που εξ αρχής είχε ο ίδιος την ευθύνη να πράξει, δηλαδή τη σοβαρή και αντικειμενική αξιολόγηση του προσωπικού του Ιδρύματος. Αποκορύφωμα της ανεύθυνης στάσης του ήταν η εγκατάλειψη του Ιδρύματος εν μέσω διαπραγματεύσεων και της σοβαρότερης κρίσης στην ιστορία του, όπως ο ίδιος κατ' επανάληψη έχει αναφέρει, για να παίξει θέατρο στο Παρίσι, τον Ιουλιανό τον Παραβάτη, παραβαίνοντας το ύψιστο των καθηκόντων του, εκείνο του Πρύτανη του αρχαιότερου και εμβληματικότερου Πανεπιστημίου της Ελλάδας.
 
Ο κ. Πελεγρίνης ισχυρίζεται ότι αγωνίζεται για την προάσπιση του Δημόσιου Πανεπιστημίου και ειδικώς του ΕΚΠΑ, ξεχνώντας ότι, εκτός των όσων συμβαίνουν σήμερα και πλήττουν καίρια το Ίδρυμα, επί θητείας του και ειδικά τα δύο τελευταία χρόνια το Πανεπιστήμιο Αθηνών, σύμφωνα με τον ισολογισμό του 2012 που υπέβαλε προς έγκριση στο Συμβούλιο, έχασε περισσότερα από 70 εκατομμύρια ευρώ από ζημίες του χαρτοφυλακίου κινητών αξιών, όταν ο ετήσιος προϋπολογισμός του ΕΚΠΑ είναι 18 εκατομμύρια ευρώ.
 
Από τις ζημίες αυτές, ¤6.704.588,07 μόνον προέρχονται από την «αναγκαστική» διαχείριση της ΤτΕ κατά το PSI και οι υπόλοιπες από διαχείριση του χαρτοφυλακίου από τις υπηρεσίες του Πανεπιστημίου των οποίων προΐσταται. Να σημειωθεί ότι ο κ. Πελεγρίνης δεν πρότεινε στο Συμβούλιο κανέναν Αναπληρωτή Πρύτανη με αρμοδιότητα τα οικονομικά, αναλαμβάνοντας προσωπικά εξ ολοκλήρου την ευθύνη και παρά το γεγονός ότι του συνεστήθη να ζητήσει το Πανεπιστήμιο τη γνώμη ειδικών επιστημόνων σε χρηματοπιστωτικά θέματα. Για τον λόγο αυτό αλλά και άλλους που επίσης δείχνουν σοβαρή οικονομική βλάβη του ΕΚΠΑ κατά την πρυτανεία του κ. Πελεγρίνη, το Συμβούλιο Ιδρύματος με την απόφασή του της 13ης Οκτωβρίου 2013 δεν ενέκρινε τον ισολογισμό του 2012 και ζήτησε ομόφωνα να γίνει άμεσα έλεγχος από ορκωτούς λογιστές τόσο στον Τακτικό Προϋπολογισμό όσο και στην εν γένει διαχείριση της Περιουσίας του Ιδρύματος καθώς και τον Ειδικό Λογαριασμό.
 
Σε απάντηση όλων αυτών ο κ. Πελεγρίνης υπέβαλε αγωγή εναντίον των μελών του Συμβουλίου ζητώντας αποζημίωση 1.000.000 ευρώ και επεχείρησε επανειλημμένα να εμφανίσει το Συμβούλιο ως υποχείριο δυνάμεων που επιβουλεύονται το Δημόσιο Πανεπιστήμιο. Έφθασε δε στο θλιβερό σημείο να παραλληλίσει διακεκριμένους επιστήμονες με δημοκρατικό ήθος και πεποιθήσεις με γνωστό φιλόσοφο «Ναζί» Πρύτανη. Δεν σταμάτησε όμως εδώ αλλά συνέχισε παρομοιάζοντας τους συναδέλφους του μέλη του Συμβουλίου ως «πέμπτη φάλαγγα του Φράνκο». Μόνον όποιος δεν είναι σε θέση να σκεφτεί ότι μπορεί να υπάρχει δράση, ανιδιοτελής και ανεξάρτητη, με γνώμονα το καθήκον και το δημόσιο συμφέρον, είναι δυνατόν να προβαίνει σε τέτοιους ισχυρισμούς και χαρακτηρισμούς, οι οποίοι απάδουν προς την ιδιότητα του ακαδημαϊκού δασκάλου και μάλιστα αυτού που φέρει δημόσιο αξίωμα.
 
Το Συμβούλιο του Ιδρύματος καλεί εκ νέου το Υπουργείο Παιδείας να αποκαταστήσει άμεσα τον κατάλογο των υπό διάθεση υπαλλήλων, μετά από σχολαστικό έλεγχο των υπηρεσιακών φακέλων τους. Οι υπάλληλοι του Πανεπιστημίου μας ακόμη και σήμερα δυστυχώς δεν έχουν πρόσβαση σε αυτούς, υπό το πρόσχημα της συνεχιζόμενης απεργίας, ενώ είναι γνωστό ότι το κτήριο στο οποίο στεγάζονται οι διοικητικές υπηρεσίες είναι προσβάσιμο επιλεκτικά σε ορισμένους υπαλλήλους. Επίσης, καλεί την ηγεσία του Υπουργείου να διασφαλίσει την κινητικότητα των υπαλλήλων που θα τεθούν σε διαθεσιμότητα μετά την ορθή αναμοριοδότησή τους. Ο διάλογος και η συνεργασία σ' ένα ανοιχτό Πανεπιστήμιο είναι ο μοναδικός δρόμος για την επίλυση των προβλημάτων που έχει δημιουργήσει στο Ίδρυμα η διαθεσιμότητα των υπαλλήλων του.
 
Το Συμβούλιο του Ιδρύματος θέλει να διαβεβαιώσει όλα τα μέλη του ΕΚΠΑ ότι με όσες δυνάμεις διαθέτει δεν θα επιτρέψει σε ομάδες και φέουδα να νέμονται τον ιστορικό αυτό θεσμό και να κρατούν καθηλωμένες τις ζωντανές δυνάμεις της ακαδημαϊκής κοινότητας. Θα συνεχίσει να εργάζεται άοκνα ώστε το Πανεπιστήμιο Αθηνών να ανταποκριθεί στις προσδοκίες των φοιτητών του και τις ελπίδες της Ελληνικής κοινωνίας».